Gebze Tren İstasyonundan günde 24 hızlı tren seferi gerçekleşmektedir. İlk tren, saat 05:04'te Söğütlüçeşme yönüne doğru, son tren ise saat 23:41'de Ankara yönüne doğru hareket etmektedir.
| Kalkış saati | Tren | Varış istasyonu | Sefer günleri |
|---|---|---|---|
| 08:22 | Ada Ekspresi | Adapazarı | Her gün |
| 11:36 | Ada Ekspresi | Adapazarı | Her gün |
| 17:28 | Ada Ekspresi | Adapazarı | Her gün |
| 18:26 | Ada Ekspresi | Adapazarı | Her gün |
| 21:23 | Ada Ekspresi | Adapazarı | Her gün |
| 07:13 | Ada Ekspresi | Pendik | Her gün |
| 08:23 | Ada Ekspresi | Pendik | Her gün |
| 14:28 | Ada Ekspresi | Pendik | Her gün |
| 16:15 | Ada Ekspresi | Pendik | Her gün |
| 20:13 | Ada Ekspresi | Pendik | Her gün |
Gebze Tren İstasyonundan günde 10 bölgesel tren seferi gerçekleşmektedir. İlk tren, saat 08:22'de Adapazarı yönüne doğru, son tren ise saat 20:13'te Pendik yönüne doğru hareket etmektedir.
| Kalkış saati | Tren | Varış istasyonu | Sefer günleri |
|---|---|---|---|
| 05:04 | Ankara Ekspresi | Halkalı | Her gün |
| 23:41 | Ankara Ekspresi | Ankara | Her gün |